Metabolismo del Nitrógeno (IP: Eulogio J. Bedmar)

Nombre del grupo o línea de investigación: Metabolismo del Nitrógeno

IP: Eulogio J. Bedmar

Researcher ID: A-3641-2008

ORCID: 0000-0002-9421-1460

Adscripción: Departamento de Microbiología del Suelo y Sistemas Simbióticos, Estación Experimental del Zaidín, Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC).

Página web: http://www.eez.csic.es/metabolismo-del-nitrogeno

Descripción de los objetivos y líneas de trabajo:

Obtener conocimientos sobre la desnitrificación utilizando bacterias endosimbióticas de los géneros Bradyrhizobium, Rhizobium y Sinorhizobium como modelo para estudiar el proceso tanto en vida libre como en simbiosis con leguminosas. Para ello, se contempla el estudio integrado de los factores ambientales, genes y enzimas, y procesos de óxido-reducción, que intervienen en la desnitrificación, prestando especial interés a la identificación de los reguladores transcripcionales que controlan su expresión y actividad y a la caracterización del mecanismo molecular de dichos reguladores.
Por otra parte, se pretende analizar el metagenoma, abundancia relativa, diversidad funcional y actividad de las poblaciones de las bacterias desnitrificantes en muestras medioambientales, fundamentalmente aguas y sedimentos, contaminados con nitratos.
En la interacción planta-bacteria-medio ambiente, se trata de establecer las relaciones entre fijación de N2, asimilación de nitrato y desnitrificación para definir los factores ambientales y los reguladores implicados en la reducción de la emisión de óxido nítrico (NO) y óxido nitroso (N2O), potentes gases de efecto invernadero implicados en el cambio climático global. La biodiversidad de bacterias que nodulan leguminosas es también objeto de nuestra investigación.

Publicaciones representativas recientes:

  1. Bedmar EJ, Bueno E, Correa-Galeote D, Torres MJ, Delgado MJ, Mesa S. 2013. Ecology of denitrification in soils and plant-associated bacteria. In: Beneficial plant-microbial interactions: Ecology and applications. Eds. B. Rodelas y J. González., pp. 164-182. CRC Press, Boca Ratón, Florida, USA. ISBN: 9781466587175.
  2. Torres MJ, Argandoña M, Vargas C, Bedmar EJ, Fischer HM, Mesa S, Delgado MJ. 2014. The global response regulator RegR controls expression of denitrification genes in Bradyrhizobium japonicum. Plos One. DOI: 10.1371/journal.pone.0099011
  3. Tortosa G, Hidalgo A, Salas A, Bedmar EJ, Mesa S, Delgado MJ. 2015. Nitrate and flooding induce N2O emissions from soybean nodules. Symbiosis. DOI 10.1007/s13199-015-0341-3.
  4. Cabrera JJ, Salas A, Torres MJ, Bedmar EJ, Richardson DJ, Gates AJ, Delgado MJ. 2016. An integrated biochemical system for nitrate assimilation and nitric oxide detoxification in Bradyrhizobium japonicum. Biochem J. 473:297-309.
  5. Bueno E, Robles E, Torres MJ, Krell T, Bedmar EJ, Delgado MJ, Mesa S. 2017. Disparate response to microoxia and nitrogen oxides of the Bradyrhizobium japonicum napEDABC, nirK and norCBQD denitrification genes. Nitric Oxide. http://dx.doi.org/10.1016/j.niox.2017.02.002.

Miembros del grupo

  • Eulogio J. Bedmar. Profesor de Investigación del CSIC (IP)
  • María Jesús Delgado Igeño. Investigadora Científica del CSIC
  • María Socorro Mesa Banqueri. Científica Titular del CSIC
  • Alba Hidalgo García. Titulada Superior. Personal Indefinido No Fijo
  • Juan José Cabrera Rodríguez. Titulado Superior contratado
  • Ana Salas Huertas. Personal Investigador en formación. FPU-Ministerio de Educación, Cultura y Deporte.
  • Antonio Castellano Hinojosa. Personal Investigador en formación. FPU-Ministerio de Educación, Cultura y Deporte.
  • Andrea Jiménez Leyva. Personal Investigador en Formación. Junta de Andalucía
  • Sergio Parejo Treviño. Personal Investigador en formación. FPU-Ministerio de Educación, Cultura y Deporte.
  • Pedro José Pacheco Márquez. Personal Investigador en formación. FPU-Ministerio de Educación, Cultura y Deporte.
  • Germán Tortosa Muñoz. Técnico Especializado de Organismos Públicos de Investigación
  • Francisca López Molina. Técnico Superior de Gestión y Servicios Comunes.

Técnicas y métodos destacados en la investigación

  • Cromatografía gaseosa (óxido nitroso, acetileno, metano, etc.).
  • Detección de óxido nítrico (NO) mediante el uso de electrodos específicos.
  • Detección de citocromos c.
  • Western-blot e inmunodetección de proteínas.
  • Expresión y purificación de proteínas (recombinantes y genuinas).
  • Cromatografía de afinidad, exclusión molecular, intercambio iónico.
  • Asilamiento ADN de muestras medioambientales.
  • Secuenciación masiva: Pirosecuenciación, Illumina.
  • Aislamiento de ARN de cultivos en vida libre y de nódulos
  • Análisis de la expresión génica mediante la utilización de fusiones transcripcionales, qRT-PCR y microarrays.
  • Transcripción in vitro.
  • Caracterización de promotores mediante técnicas de extensión de cebador (RACE, FLOE, primer extension, etc.).
  • Técnicas de interacción proteína-ADN.

 

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