Interacción simbiótica entre Sinorhizobium fredii HH103 y sus leguminosas hospedadoras (IP: José Enrique Ruiz Sainz)

JoseEnrique et al

Nombre del grupo o línea de investigación: Interacciones Planta-Bacteria

  • Director del grupo PAIDI AGR162: José Enrique Ruiz Sainz

ORCID: 0000-0003-0106-3495

Adscripción: Departamento de Microbiología, Facultad de Biología, Universidad de Sevilla.

Página web: https://investigacion.us.es/sisius/sis_showpub.php?idpers=80

  • IP proyectos: José María Vinardell González

Researcher ID: H-5355-2013

ORCID: 0000-0002-7105-5389

Adscripción: Departamento de Microbiología, Facultad de Biología, Universidad de Sevilla.

Página web: https://investigacion.us.es/sisius/sis_showpub.php?idpers=5711

  • IP proyectos: Francisco Javier López Baena

Researcher ID: L-4670-2014

ORCID: 0000-0001-7799-0338

Adscripción: Departamento de Microbiología, Facultad de Biología, Universidad de Sevilla.

Página web: https://investigacion.us.es/sisius/sis_showpub.php?idpers=8730

Descripción de los objetivos y líneas de trabajo:

  1. Estudio de nuevos genes de S. fredii HH103 con posible papel simbiótico.
  2. Estudio del rango de nodulación de S. fredii HH103 en diversas líneas de sojas salvajes y con la leguminosa modelo Lotus.
  3. Estudio del papel del sistema de secreción de tipo 3 en la interacción simbiótica rizobio-leguminosa.

Publicaciones representativas recientes:

  1. Acosta-Jurado S, Alias-Villegas C, Navarro-Gómez P, Zehner S, Murdoch PD, Rodríguez-Carvajal MA, Soto MJ, Ollero FJ, Ruiz-Sainz JE, Göttfert M, Vinardell JM (2016) The Sinorhizobium fredii HH103 MucR1 global regulator is connected with the nod regulon and is required for efficient symbiosis with Lotus burttii and Glycine max cv. Williams. Mol Plant Microbe Interact 29: 700-712.
  2. Acosta-Jurado S, Rodríguez-Navarro DN, Kawaharada Y, Perea JF, Gil-Serrano A, Jin H, An Q, Rodríguez-Carvajal MA, Andersen SU, Sandal N, Stougaard J, Vinardell JM, Ruiz-Sainz JE (2016) Sinorhizobium fredii HH103 invades Lotus burttii by crack entry in a Nod factor and surface polysaccharide-dependent manner. Mol Plant Microbe Interact 29: 925-937.
  3. Pérez-Montaño F, Jiménez-Guerrero I, Acosta-Jurado S, Navarro-Gómez P, Ollero FJ, Ruiz-Sainz JE, López-Baena FJ, Vinardell JM (2016) A transcriptomic analysis of the effect of genistein on Sinorhizobium fredii HH103 reveals novel rhizobial genes putatively involved in symbiosis. Sci Rep 6: 31592.
  4. Jiménez-Guerrero I, Pérez-Montaño F, Medina C, Ollero FJ, López-Baena FJ (2016) NopC is a Rhizobium-specific type 3 secretion system effector secreted by Sinorhizobium (Ensifer) fredii HH103. PLoS ONE 10: e0142866.
  5. Vinardell JM, Acosta-Jurado S, Zehner S, Göttfert M, Becker A, Baena I, Blom J, Crespo-Rivas JC, Goesmann A, Jaenicke S, Krol E, McIntosh M, Margaret I, Pérez-Montaño F, Schneiker-Bekel S, Serranía J, Szczepanowski R, Buendía AM, Lloret J, Bonilla I, Pühler A, Ruiz-Sainz JE, Weidner S (2015) The Sinorhizobium fredii HH103 genome: a comparative analysis with S. fredii strains differing in their symbiotic behavior with soybean. Mol Plant Microbe Interact 28: 811-824.
  6. Jiménez-Guerrero I, Pérez-Montaño F, Monreal JA, Preston GM, Fones H, Vioque B, Ollero FJ, López-Baena FJ (2015) The Sinorhizobium (Ensifer) fredii HH103 type 3 secretion system suppresses early defense responses to effectively nodulate soybean. Mol Plant Microbe Interact 28: 790-799.

Miembros del grupo

Dr. José Enrique Ruiz Sainz

Dr. José María Vinardell González

Dr. Francisco Javier López Baena

Dra. Ana María Buendía Clavería

Dr. Juan Carlos Crespo Rivas

Dra. Nuria Madinabeitia Peiró.

Sr. Sebastián Acosta Jurado

Sra. Pilar Navarro Gómez

Técnicas y métodos destacados en la investigación

  • Obtención de mutantes bacterianos por PCR solapante o por inserción de casetes con genes informadores.
  • Análisis de la producción de polisacáridos superficiales (glucanos cíclicos, exopolisacáridos, lipopolisacáridos, polisacáridos capsulares tipo antígeno K): técnicas electroforéticas, cuantificación de azúcares, RMN y HPLC, técnicas de aislamiento e identificación de factores de nodulación (en colaboración con el grupo de los Dres. Gil Serrano y Rodríguez Carvajal, Dpto. Química Orgánica, Universidad de Sevilla).
  • Análisis de diversas capacidades bacterianas: formación de biopelículas, auto-agregación, motilidad tipo swimming y en superficie, etc.
  • Análisis de las capacidades simbióticas de estirpes rizobianas en diversas plantas hospedadoras. Cuantificación de actividad nitrogenasa. Estudio de la capacidad de infección e invasión.
  • Extracción y separación de proteínas; western blot; expresión y purificación de proteínas en Escherichia coli; co-inmunoprecipitación de proteínas (sobreexpresión en Nicotiana benthamiana con Agrobacterium tumefaciens y posterior identificación por MS); localización y co-localización intracelular de proteínas fusionadas a YFP, CFP o RFP (microscopía confocal); bi-molecular fluorescence complementation (Bi-FC); estudios de fosforilación in vitro de proteínas; expresión de proteínas en levaduras; doble híbrido en levaduras.
  • Estudios de expresión de genes de plantas mediante qPCR; análisis de expresión génica en bacterias: fusiones con genes informadores, qPCR, trascriptómica (RNAseq); estudios de expresión in vivo de genes bacterianos en raíces de plantas infectadas mediante fusiones génicas a luxCDABE.
  • Estudios de localización de bacterias marcadas con fluoróforos en raíces de plantas infectadas (superficie, tubos de infección, nódulos) o teñidas con SYTO-13; estudios de traslocación de efectores al interior de la célula hospedadora mediante fusión a la enzima adenilato ciclasa.

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